1.提出申请意向。企业向认证机构提出申请认证的意向，询问需要了解的事项，并索取有关资料。
2.咨询辅导师进企业诊断。如果企业有需要，可向有关的咨询机构提出咨询申请，咨询机构会派专家指导企业建立质量体系，编制质量手册，进行质量体系审核（预检查）。
3.提出正式申请。企业填写认证申请书，附上质量手册，寄交（或送交）有关认证机构。
4.认证机构审查申请书，同意后向企业发出接受申请的通知，告知应缴纳的费用。
5.企业按通知书的要求交纳费用。签署合同，辅导老师进企业进行辅导或培训。
6.指导企业建立体系文件，进行文件运行，指导现场整改。

7.向认证公司申请现场审核，检查组审查企业提交的质量手册是否符合标准；如不符合，向申请企业提出，请其修改或提供补充材料，直至基本符合为止。

8.检查组去现场检查和评定申请企业质量体系的实际运行情况，质量手册的贯彻执行情况；检查结束前，由检查组长向企业领导报告检查评定的初步结果，告知推荐、推迟推荐或不推荐的结论。

9.如果是"推迟推荐"，企业应制定纠正措施，企业在辅导老师的协助下进行问题整改，在检查组指定的期限内完成，达到满意的效果，并将纠正措施及其实施情况书面报告。
10.检查组编写并向认证机构提交质量体系检查报告。
11.认证公司向企业颁发证书。认证机构审查质量体系检查报告，符合要求时，向企业颁发认证。如果经审查不符合要求时，应向申请企业发出书面通知，告知不推荐的原因。

12.体系运行后续维护跟踪。企业坚持并不断改进质量体系，提高产品质量，接受认证机构的定期监督复查。

认证申请流程：
    1、提出认证申请
    2、申请方提交文件、资料
    3、合同评审
    4、签订认证合同
    5、进入认证程序

ISO9001质量管理体系认证流程分为以下四个步骤：

1、ISO9001质量管理体系认证的申请:        

1.1.申请方提供1份正规的自己授予权力代表签名的申请书.申请书或其附件应该有以下文件:    

 1)申请方介绍, 比如说单位的性质、名称、单位地址、法律符合、和相关的工作人员和技术资源。     

 2)申请质量管理体系认证流程的所涵盖的产品或服务内容。     
 
 3)法人营业执照影印件，需要时提交资质证明材料、生产许可证复印件等。     

 4)相关咨询机构以及咨询人员列表。     
 
 5)近期的国家产品质量监督审查记录。     
 
 6)有关质量体系及活动的一般信息。     
 
 7)申请人认同ISO9001质量管理体系认证流程及要求, 并且提供认证所需要的各种信息。     

 8)体系认证所用到的标准其它需要的文件说明材料。     

1.2.认证中心按照申请人的要求提供相关的公开文件。     

1.3.认证中心一旦接到申请方的ISO9001认证材料之日起, 在合同评价之后的一个月内作出受理、拒接或改善后在接受的决定, 并告知委托方（受审核方）。以保证：    
  
  A.ISO9001质量管理体系认证流程能够明确, 总结成文件并能够被接受;    

  B.认证中心与申请者彼此的不同点能够得到解决;    

  C.对于申请者申请的认证范围, 运行场地及一些特别要求, 如申请者使用的语言等,认证机构能够很好地实施认证流程;    

  D.质量管理体系认证中心可以向被审核者补充材料和一些说明。     

1.4.签署质量体系认证合同文件。       

当认证安排或认证要求如果要做出回应的时，由认证机构代表承担按认证机构收到的文件来回应，然后再公布。    

1.5.对收到的信息将用于现场审核评定的准备。认证中心承诺保密并妥善保管。        

2.提前做好现场审核的准备        

2.1.在现场审核开始以前, 申请方的ISO9000质量管理体系，时间必须应达到三个月以上，需要提早两月向认证机构递交质量管理文件。      

2.2.认证中心开始构成审核委员会, 专门指定特定审核员的一部分进行质量文件进行核查、审查以后填写《质量手册审查表》通知受审核方, 并保存记录。     

2.3.认证中心在文件审查结束之后, 与受审核方协商确定审核日期并考虑必要的认证流程。在初次审核前，受审核方应至少提供一次内部质量审核和管理评审的实施记录。     

2.4.认证中心任命一个合格的审核组, 确定审核组长、组成审核组代表认证中心实施现场审核。    

 A.审核组成员由国家注册审核员担任。     

 B.必要时聘请专业的技术专家协助审核。     

 C.审核组成员、人员组成。一般是认证中心提前告诉受审核方同时询问被审核方对所安排的审核人员有没有意见。若上述人员与受审核方有发生利益挂钩的可能性时, 受审方可以要求撤换人员, 但是必须首先通过认证中心的允许。    

2.5.认证中心成立审核组, 确立ISO9001质量管理体系认证流程, 审核日程和日期安排必须要通过受审核方的允许, 某些情况下允许在编写审核安排之前对受审核进行初步审查  

3.现场审核:审核按照受审核方要求的认证规定, 在指定的产品领域内被审核方的ISO9001质量管理体系,认证流程为:    

3.1.主持首次会议:     

 A.说明审核组人员构成及分工安排。    

 B.说明审核主要目标, 根源文件和领域。     

 C.说明审核计划, 制定审核计划及需要解决的问题。      

3.2.开始现场审核 重点收集证据对不符合的项目开具不符合报告文件.评判不符合项目的标准是:    

 A.重大不符合是指:质量管理体系跟被要求的质量管理体系标准文件的不一致; 造成关键要求严重失效的不符合或可能造成重大问题的不符合,可能引发产品质量不过关。      

 B.一般不符合项是指:一意孤行的人为造成的错误;文件有可能未被重视造成后果不算太重大, 对关键核心不会产生重大问题的不符合等。     

 3.3.审核委员会写审核资料做出审核结果, 其审核结论有三种可能:    

 1)只有少数不符合, 一般建议通过认证。     

 2)有很多重大的不符合项目, 一时间难以改正, 一般建议不予通过认证。    

 3)有少数重大不符合, 但可以很快改正, 一般建议推迟通过认证。     

3.4.向审核方通知审核结论。     

3.5.开始最后一次会议, 朗读审核文件, 委托审核方进行确认。     

3.6.认证机构跟踪被审核方对审核问题采取纠正方案的效果如何。     

 4.认证批复     

4.1.认证中心对审核结果进行评定、批准自现场审核后30天最迟不超过60天告知受被审核方面, 开始加入认证后的监督管理。    

4.2.认证中心对认证通过登记认证中心管理人批复的认证证书直接负责, 而且在规定的载体上更新ISO9001质量管理体系认证注册单位名单。

4.3.对没通过认证的企业, 认证中心要给出具体通知, 说明没有通过的原因, 企业需要在提交申请,但必须间隔半年。